Озеро Шотозеро расположено в южной части Карелии и входит в систему реки Шуи. Площадь водной поверхности — 74 кв. км. Длина — 15,6 км, наибольшая ширина — 7,2 км. Средняя глубина — 3,1 м, наибольшая—10,1 м. На озере 43 острова. Шотозеро овальной формы, вытянуто с северо-запада на юго-восток. Через него проходит река Шуя, поэтому оно имеет усиленную проточность. Кроме Шуи, в Шотозеро впадает река Миккелица. Вода коричневого оттенка. Отлогие, каменистые берега покрыты хвойным и лиственным лесом.